新疆占我国国土面积的1/6，以天山山脉为界，地理上分为南疆、北疆。
南疆是天山以南的广袤地区，和北边的绝美风光不同，南疆版图中有世界第二大沙漠，“进去了就出不来”的塔特拉马干沙漠，可以想见南疆的自然环境较为恶劣，多以沙漠和盐碱地为主，这里是维吾尔族的主要聚居地。所谓“北疆看风景，南疆看人文”，在这片历史厚重的土地上，隐藏着曾经的西域三十六国，是古代丝绸之路的核心区域。
南疆自古以来就是一个多民族聚居的地区，汉、维吾尔、塔吉克、柯尔克孜等民族的艺术和绚丽多彩的风情，构成了具有浓郁民族特色的人文景观。在古丝绸之路的南、中两条干线上留下的数以百计的古城池、古墓葬、千佛洞等古迹昭示着历史的悠长与沧桑。
新疆的地理特征是“三山夹两盆”，新疆最北部为阿尔泰山，中部为天山，最南部为昆仑山系。阿尔泰山和天山之间为准噶尔盆地，天山和昆仑山系之间为塔里木盆地。天山以南，昆仑山以北，称之为南疆。南疆幅员辽阔，干旱少雨，塔克拉玛干沙漠周围有许多绿洲。
南疆干旱，每年春夏之交遮天蔽日的沙尘，还有令棉苗枯萎、令杏花凋零的倒春寒，以及干热风、冰雹、洪水等。恶劣的自然条件使得南疆农业成为典型的弱质产业，进而使天山以南广大区域成为脱贫致富难度最大的地区，仍有为数不少的农村人口尚未解决温饱。
南疆同时也是富有的。浩瀚的塔克拉玛干沙漠底下埋藏着储量可观的石油、天然气以及各种宝贵的矿产资源，沙漠周围的天山、喀喇昆仑山、阿尔金山同样蕴藏着丰富的煤炭、有色金属、黑色金属……塔里木盆地周边大大小小的绿洲，经过千百年的开垦、耕耘，已经形成了相对完善的灌溉体系，加上充足的光热资源，已经成为中国最重要的优质棉生产基地以及特色林果基地。
南疆重要地区——喀什，素有“不到喀什不算到新疆”的美誉。喀什地区位于祖国西陲、新疆维吾尔自治区西南部，东临塔克拉玛干大沙漠，南依喀喇昆仑山与西藏阿里地区为邻，西靠帕米尔高原，东北与阿克苏地区柯坪县、阿瓦提县相连，西北与克孜勒苏柯尔克孜自治州的阿图什市、乌恰县、阿克陶县相连，东南与和田地区皮山县相连。喀什地区的西南部与三个国家接壤：西部与塔吉克斯坦相连、西南与阿富汗、巴基斯坦接壤；边境线长388千米。全地区东西宽约750千米，南北长535千米，总面积111794.03平方千米。
喀什地区三面环山，一面敞开，北有天山南脉横卧，西有帕米尔高原耸立，南部是喀喇昆仑山，东部为塔克拉玛干大沙漠。诸山和沙漠环绕的叶尔羌河、喀什噶尔河冲积平原犹如绿色的宝石镶嵌其中。
整个地势由西南向东北倾斜。地貌轮廓是由稳定的塔里木盆地、天山、昆仑山地槽褶皱带为主的构造单元组成。印度洋的湿润气流难以到达，北冰洋的寒冷气流也较难穿透，造成喀什地区干旱炎热的暖温带的荒漠景观。而山区的冰雪融水给绿洲的开发创造了条件，形成较集中的喀什噶尔和叶尔羌河两大著名绿洲。境内最高的乔戈里峰海拔8611米，最低处塔克拉玛干大沙漠海拔1100米，喀什市城区的平均海拔高度1289米。